Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C17orf50Q8WW18 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C17orf50Q8WW18 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C17orf50Q8WW18 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C17orf50Q8WW18 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf50Q8WW18 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf50Q8WW18 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C17orf50Q8WW18 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf50Q8WW18 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf50Q8WW18 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms