Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP35Q8NFH5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP35Q8NFH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP35Q8NFH5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUP35Q8NFH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP35Q8NFH5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NUP35Q8NFH5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms