Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDPD1Q8N9F7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDPD1Q8N9F7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDPD1Q8N9F7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDPD1Q8N9F7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDPD1Q8N9F7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDPD1Q8N9F7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDPD1Q8N9F7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDPD1Q8N9F7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDPD1Q8N9F7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDPD1Q8N9F7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDPD1Q8N9F7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDPD1Q8N9F7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms