Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAF1Q8N7H5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAF1Q8N7H5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAF1Q8N7H5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAF1Q8N7H5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAF1Q8N7H5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAF1Q8N7H5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PAF1Q8N7H5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAF1Q8N7H5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PAF1Q8N7H5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAF1Q8N7H5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAF1Q8N7H5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAF1Q8N7H5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PAF1Q8N7H5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PAF1Q8N7H5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAF1Q8N7H5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAF1Q8N7H5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 580.6 ms