Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L2

PIP4P2, Type 2 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4P2Q8N4L2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4P2Q8N4L2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIP4P2Q8N4L2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIP4P2Q8N4L2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIP4P2Q8N4L2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4P2Q8N4L2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIP4P2Q8N4L2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIP4P2Q8N4L2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4P2Q8N4L2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4P2Q8N4L2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIP4P2Q8N4L2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4P2Q8N4L2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4P2Q8N4L2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms