Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCUBE3Q8IX30 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCUBE3Q8IX30 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCUBE3Q8IX30 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCUBE3Q8IX30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCUBE3Q8IX30 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCUBE3Q8IX30 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCUBE3Q8IX30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCUBE3Q8IX30 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCUBE3Q8IX30 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCUBE3Q8IX30 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCUBE3Q8IX30 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCUBE3Q8IX30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCUBE3Q8IX30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCUBE3Q8IX30 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCUBE3Q8IX30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms