Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN4BQ8IWT1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN4BQ8IWT1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN4BQ8IWT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN4BQ8IWT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN4BQ8IWT1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN4BQ8IWT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN4BQ8IWT1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN4BQ8IWT1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN4BQ8IWT1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN4BQ8IWT1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms