Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVE0

CROCCP3, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCP3Q8IVE0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CROCCP3Q8IVE0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCCP3Q8IVE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CROCCP3Q8IVE0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CROCCP3Q8IVE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CROCCP3Q8IVE0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROCCP3Q8IVE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCCP3Q8IVE0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROCCP3Q8IVE0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms