Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PALB2Q86YC2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALB2Q86YC2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PALB2Q86YC2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PALB2Q86YC2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALB2Q86YC2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PALB2Q86YC2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALB2Q86YC2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PALB2Q86YC2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PALB2Q86YC2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PALB2Q86YC2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PALB2Q86YC2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALB2Q86YC2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALB2Q86YC2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PALB2Q86YC2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALB2Q86YC2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALB2Q86YC2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALB2Q86YC2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PALB2Q86YC2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALB2Q86YC2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALB2Q86YC2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms