Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LIMS2Q7Z4I7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LIMS2Q7Z4I7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LIMS2Q7Z4I7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LIMS2Q7Z4I7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIMS2Q7Z4I7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LIMS2Q7Z4I7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LIMS2Q7Z4I7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LIMS2Q7Z4I7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LIMS2Q7Z4I7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIMS2Q7Z4I7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIMS2Q7Z4I7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LIMS2Q7Z4I7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LIMS2Q7Z4I7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LIMS2Q7Z4I7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms