Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP47Q6ZTR5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP47Q6ZTR5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP47Q6ZTR5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP47Q6ZTR5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP47Q6ZTR5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP47Q6ZTR5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP47Q6ZTR5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP47Q6ZTR5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP47Q6ZTR5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP47Q6ZTR5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP47Q6ZTR5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP47Q6ZTR5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP47Q6ZTR5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP47Q6ZTR5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFAP47Q6ZTR5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CFAP47Q6ZTR5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP47Q6ZTR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP47Q6ZTR5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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