Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RFLNAQ6ZTI6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFLNAQ6ZTI6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFLNAQ6ZTI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RFLNAQ6ZTI6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFLNAQ6ZTI6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFLNAQ6ZTI6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RFLNAQ6ZTI6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RFLNAQ6ZTI6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFLNAQ6ZTI6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFLNAQ6ZTI6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFLNAQ6ZTI6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFLNAQ6ZTI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RFLNAQ6ZTI6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFLNAQ6ZTI6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFLNAQ6ZTI6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFLNAQ6ZTI6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFLNAQ6ZTI6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFLNAQ6ZTI6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFLNAQ6ZTI6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFLNAQ6ZTI6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFLNAQ6ZTI6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFLNAQ6ZTI6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFLNAQ6ZTI6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFLNAQ6ZTI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFLNAQ6ZTI6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFLNAQ6ZTI6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms