Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNL6

FGD5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD5Q6ZNL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
FGD5Q6ZNL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
FGD5Q6ZNL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
FGD5Q6ZNL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
FGD5Q6ZNL6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
FGD5Q6ZNL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
FGD5Q6ZNL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
FGD5Q6ZNL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.75■■■■■ 5.07
FGD5Q6ZNL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
FGD5Q6ZNL6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
FGD5Q6ZNL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
FGD5Q6ZNL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
FGD5Q6ZNL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
FGD5Q6ZNL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
FGD5Q6ZNL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
FGD5Q6ZNL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
FGD5Q6ZNL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.63■■■■■ 5.06
FGD5Q6ZNL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC46.61■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC46.59■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
FGD5Q6ZNL6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
FGD5Q6ZNL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
FGD5Q6ZNL6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
FGD5Q6ZNL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
FGD5Q6ZNL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.51■■■■■ 5.04
FGD5Q6ZNL6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
FGD5Q6ZNL6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC46.5■■■■■ 5.03
FGD5Q6ZNL6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
FGD5Q6ZNL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.46■■■■■ 5.03
FGD5Q6ZNL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
FGD5Q6ZNL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
FGD5Q6ZNL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.43■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC46.42■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
FGD5Q6ZNL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
FGD5Q6ZNL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC46.37■■■■■ 5.01
FGD5Q6ZNL6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
FGD5Q6ZNL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
FGD5Q6ZNL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
FGD5Q6ZNL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
FGD5Q6ZNL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
FGD5Q6ZNL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
FGD5Q6ZNL6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
FGD5Q6ZNL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
FGD5Q6ZNL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC46.28■■■■■ 5
FGD5Q6ZNL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC46.25■■■■■ 5
FGD5Q6ZNL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
FGD5Q6ZNL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 5
FGD5Q6ZNL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
FGD5Q6ZNL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
FGD5Q6ZNL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
FGD5Q6ZNL6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
FGD5Q6ZNL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC46.18■■■■■ 4.98
FGD5Q6ZNL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC46.18■■■■■ 4.98
FGD5Q6ZNL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
FGD5Q6ZNL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
FGD5Q6ZNL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
FGD5Q6ZNL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
FGD5Q6ZNL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
FGD5Q6ZNL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
FGD5Q6ZNL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
FGD5Q6ZNL6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.07■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC46.02■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
FGD5Q6ZNL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC46■■■■■ 4.95
FGD5Q6ZNL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC46■■■■■ 4.95
FGD5Q6ZNL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
FGD5Q6ZNL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
FGD5Q6ZNL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
FGD5Q6ZNL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.95■■■■■ 4.95
FGD5Q6ZNL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
FGD5Q6ZNL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
FGD5Q6ZNL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.93■■■■■ 4.94
FGD5Q6ZNL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
FGD5Q6ZNL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
FGD5Q6ZNL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
FGD5Q6ZNL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.94
FGD5Q6ZNL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
FGD5Q6ZNL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
FGD5Q6ZNL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.86■■■■■ 4.93
FGD5Q6ZNL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
FGD5Q6ZNL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
FGD5Q6ZNL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
FGD5Q6ZNL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms