Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SLC4A10Q6U841 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLC4A10Q6U841 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLC4A10Q6U841 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SLC4A10Q6U841 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLC4A10Q6U841 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLC4A10Q6U841 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SLC4A10Q6U841 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLC4A10Q6U841 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLC4A10Q6U841 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLC4A10Q6U841 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SLC4A10Q6U841 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SLC4A10Q6U841 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC4A10Q6U841 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLC4A10Q6U841 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLC4A10Q6U841 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC4A10Q6U841 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLC4A10Q6U841 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLC4A10Q6U841 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC4A10Q6U841 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLC4A10Q6U841 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLC4A10Q6U841 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLC4A10Q6U841 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
SLC4A10Q6U841 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLC4A10Q6U841 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SLC4A10Q6U841 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SLC4A10Q6U841 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SLC4A10Q6U841 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLC4A10Q6U841 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms