Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RETSATQ6NUM9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RETSATQ6NUM9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RETSATQ6NUM9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RETSATQ6NUM9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RETSATQ6NUM9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RETSATQ6NUM9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RETSATQ6NUM9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RETSATQ6NUM9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RETSATQ6NUM9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RETSATQ6NUM9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RETSATQ6NUM9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RETSATQ6NUM9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RETSATQ6NUM9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RETSATQ6NUM9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RETSATQ6NUM9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RETSATQ6NUM9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RETSATQ6NUM9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RETSATQ6NUM9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms