Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTC19Q6DKK2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC19Q6DKK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TTC19Q6DKK2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTC19Q6DKK2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC19Q6DKK2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC19Q6DKK2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TTC19Q6DKK2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC19Q6DKK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms