Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF220Q5VTB9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF220Q5VTB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF220Q5VTB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF220Q5VTB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF220Q5VTB9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF220Q5VTB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF220Q5VTB9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF220Q5VTB9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms