Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM74A1Q5RGS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM74A1Q5RGS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM74A1Q5RGS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM74A1Q5RGS3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM74A1Q5RGS3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM74A1Q5RGS3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM74A1Q5RGS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms