Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf48Q5BLP8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf48Q5BLP8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C4orf48Q5BLP8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C4orf48Q5BLP8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4orf48Q5BLP8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms