Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN52Q52LA3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIN52Q52LA3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIN52Q52LA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN52Q52LA3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN52Q52LA3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIN52Q52LA3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIN52Q52LA3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms