Protein–RNA interactions for Protein: Q16718

NDUFA5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA5Q16718 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA5Q16718 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFA5Q16718 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA5Q16718 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA5Q16718 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFA5Q16718 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA5Q16718 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFA5Q16718 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA5Q16718 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA5Q16718 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA5Q16718 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA5Q16718 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA5Q16718 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA5Q16718 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA5Q16718 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA5Q16718 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms