Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKN3Q16667 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDKN3Q16667 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKN3Q16667 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDKN3Q16667 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKN3Q16667 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKN3Q16667 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKN3Q16667 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDKN3Q16667 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDKN3Q16667 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
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