Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC6Q16204 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC6Q16204 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC6Q16204 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC6Q16204 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC6Q16204 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC6Q16204 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC6Q16204 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC6Q16204 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC6Q16204 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC6Q16204 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC6Q16204 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC6Q16204 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC6Q16204 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC6Q16204 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC6Q16204 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC6Q16204 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC6Q16204 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC6Q16204 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC6Q16204 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC6Q16204 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC6Q16204 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC6Q16204 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
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