Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRRQ15256 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRRQ15256 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRRQ15256 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRRQ15256 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRRQ15256 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRRQ15256 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRRQ15256 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPRRQ15256 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPRRQ15256 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRRQ15256 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPRRQ15256 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPRRQ15256 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRRQ15256 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRRQ15256 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRRQ15256 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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