Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1CQ13936 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA1CQ13936 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNA1CQ13936 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNA1CQ13936 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA1CQ13936 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA1CQ13936 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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