Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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