Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PMS2P11Q13670 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PMS2P11Q13670 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMS2P11Q13670 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PMS2P11Q13670 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P11Q13670 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
PMS2P11Q13670 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PMS2P11Q13670 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMS2P11Q13670 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms