Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTCH1Q13635 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTCH1Q13635 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PTCH1Q13635 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTCH1Q13635 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTCH1Q13635 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTCH1Q13635 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PTCH1Q13635 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PTCH1Q13635 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTCH1Q13635 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTCH1Q13635 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTCH1Q13635 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTCH1Q13635 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTCH1Q13635 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTCH1Q13635 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTCH1Q13635 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTCH1Q13635 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTCH1Q13635 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTCH1Q13635 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTCH1Q13635 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTCH1Q13635 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTCH1Q13635 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTCH1Q13635 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTCH1Q13635 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PTCH1Q13635 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PTCH1Q13635 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PTCH1Q13635 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
PTCH1Q13635 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PTCH1Q13635 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PTCH1Q13635 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PTCH1Q13635 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTCH1Q13635 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTCH1Q13635 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTCH1Q13635 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTCH1Q13635 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTCH1Q13635 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.13■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PTCH1Q13635 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTCH1Q13635 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTCH1Q13635 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
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