Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
NEUROD1Q13562 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NEUROD1Q13562 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NEUROD1Q13562 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NEUROD1Q13562 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
NEUROD1Q13562 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NEUROD1Q13562 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NEUROD1Q13562 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NEUROD1Q13562 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NEUROD1Q13562 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NEUROD1Q13562 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NEUROD1Q13562 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NEUROD1Q13562 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NEUROD1Q13562 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms