Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB3BPQ13352 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGB3BPQ13352 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGB3BPQ13352 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGB3BPQ13352 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB3BPQ13352 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGB3BPQ13352 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGB3BPQ13352 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGB3BPQ13352 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGB3BPQ13352 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGB3BPQ13352 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB3BPQ13352 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB3BPQ13352 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB3BPQ13352 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGB3BPQ13352 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ITGB3BPQ13352 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGB3BPQ13352 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
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