Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NME3Q13232 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME3Q13232 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NME3Q13232 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NME3Q13232 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NME3Q13232 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NME3Q13232 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NME3Q13232 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME3Q13232 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME3Q13232 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME3Q13232 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NME3Q13232 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME3Q13232 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME3Q13232 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME3Q13232 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME3Q13232 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NME3Q13232 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME3Q13232 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME3Q13232 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME3Q13232 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME3Q13232 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NME3Q13232 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NME3Q13232 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NME3Q13232 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME3Q13232 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME3Q13232 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NME3Q13232 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME3Q13232 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NME3Q13232 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NME3Q13232 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME3Q13232 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME3Q13232 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NME3Q13232 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME3Q13232 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME3Q13232 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME3Q13232 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME3Q13232 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME3Q13232 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME3Q13232 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME3Q13232 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME3Q13232 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NME3Q13232 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME3Q13232 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME3Q13232 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME3Q13232 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME3Q13232 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME3Q13232 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME3Q13232 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME3Q13232 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME3Q13232 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME3Q13232 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME3Q13232 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NME3Q13232 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME3Q13232 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NME3Q13232 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME3Q13232 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME3Q13232 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME3Q13232 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME3Q13232 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME3Q13232 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME3Q13232 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME3Q13232 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME3Q13232 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME3Q13232 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME3Q13232 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME3Q13232 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME3Q13232 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME3Q13232 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NME3Q13232 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME3Q13232 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME3Q13232 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NME3Q13232 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME3Q13232 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME3Q13232 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME3Q13232 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME3Q13232 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME3Q13232 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME3Q13232 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME3Q13232 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME3Q13232 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME3Q13232 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME3Q13232 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME3Q13232 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME3Q13232 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME3Q13232 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME3Q13232 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME3Q13232 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME3Q13232 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME3Q13232 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME3Q13232 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME3Q13232 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME3Q13232 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME3Q13232 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME3Q13232 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME3Q13232 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME3Q13232 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NME3Q13232 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME3Q13232 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME3Q13232 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME3Q13232 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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