Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC47.93■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
PRDM2Q13029 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC47.84■■■■■ 5.25
PRDM2Q13029 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC47.81■■■■■ 5.24
PRDM2Q13029 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
PRDM2Q13029 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.72■■■■■ 5.23
PRDM2Q13029 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC47.69■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC47.67■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
PRDM2Q13029 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
PRDM2Q13029 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
PRDM2Q13029 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC47.53■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
PRDM2Q13029 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
PRDM2Q13029 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.42■■■■■ 5.18
PRDM2Q13029 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
PRDM2Q13029 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
PRDM2Q13029 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC47.38■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC47.33■■■■■ 5.17
PRDM2Q13029 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC47.27■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
PRDM2Q13029 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC47.19■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC47.19■■■■■ 5.15
PRDM2Q13029 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC47.19■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
PRDM2Q13029 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
PRDM2Q13029 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC47.03■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
PRDM2Q13029 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
PRDM2Q13029 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC46.96■■■■■ 5.11
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