Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
LMOD3Q0VAK6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
LMOD3Q0VAK6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMOD3Q0VAK6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMOD3Q0VAK6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMOD3Q0VAK6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMOD3Q0VAK6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMOD3Q0VAK6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMOD3Q0VAK6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMOD3Q0VAK6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMOD3Q0VAK6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LMOD3Q0VAK6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMOD3Q0VAK6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMOD3Q0VAK6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMOD3Q0VAK6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMOD3Q0VAK6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
LMOD3Q0VAK6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LMOD3Q0VAK6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LMOD3Q0VAK6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
LMOD3Q0VAK6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LMOD3Q0VAK6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LMOD3Q0VAK6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LMOD3Q0VAK6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LMOD3Q0VAK6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
LMOD3Q0VAK6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LMOD3Q0VAK6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms