Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VBP1P61758 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VBP1P61758 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VBP1P61758 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VBP1P61758 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VBP1P61758 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VBP1P61758 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VBP1P61758 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VBP1P61758 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VBP1P61758 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VBP1P61758 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VBP1P61758 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VBP1P61758 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VBP1P61758 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VBP1P61758 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VBP1P61758 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VBP1P61758 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VBP1P61758 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VBP1P61758 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VBP1P61758 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VBP1P61758 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VBP1P61758 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VBP1P61758 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VBP1P61758 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VBP1P61758 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VBP1P61758 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VBP1P61758 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VBP1P61758 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VBP1P61758 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VBP1P61758 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VBP1P61758 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VBP1P61758 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VBP1P61758 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VBP1P61758 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VBP1P61758 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VBP1P61758 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VBP1P61758 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VBP1P61758 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VBP1P61758 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VBP1P61758 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VBP1P61758 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VBP1P61758 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VBP1P61758 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VBP1P61758 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VBP1P61758 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VBP1P61758 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VBP1P61758 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VBP1P61758 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VBP1P61758 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VBP1P61758 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VBP1P61758 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VBP1P61758 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VBP1P61758 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VBP1P61758 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VBP1P61758 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VBP1P61758 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VBP1P61758 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VBP1P61758 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VBP1P61758 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VBP1P61758 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VBP1P61758 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VBP1P61758 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VBP1P61758 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VBP1P61758 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VBP1P61758 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VBP1P61758 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VBP1P61758 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VBP1P61758 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VBP1P61758 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VBP1P61758 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VBP1P61758 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VBP1P61758 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VBP1P61758 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VBP1P61758 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VBP1P61758 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VBP1P61758 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VBP1P61758 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VBP1P61758 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VBP1P61758 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VBP1P61758 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VBP1P61758 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VBP1P61758 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VBP1P61758 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VBP1P61758 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VBP1P61758 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VBP1P61758 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VBP1P61758 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VBP1P61758 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VBP1P61758 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VBP1P61758 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VBP1P61758 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VBP1P61758 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VBP1P61758 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VBP1P61758 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VBP1P61758 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VBP1P61758 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VBP1P61758 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VBP1P61758 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VBP1P61758 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VBP1P61758 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms