Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HERVK_113P61574 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P61574 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERVK_113P61574 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P61574 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERVK_113P61574 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P61574 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms