Protein–RNA interactions for Protein: P56177

DLX1, Homeobox protein DLX-1, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLX1P56177 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLX1P56177 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DLX1P56177 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLX1P56177 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DLX1P56177 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLX1P56177 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLX1P56177 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DLX1P56177 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLX1P56177 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLX1P56177 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DLX1P56177 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DLX1P56177 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DLX1P56177 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DLX1P56177 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DLX1P56177 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLX1P56177 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLX1P56177 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DLX1P56177 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DLX1P56177 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DLX1P56177 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DLX1P56177 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DLX1P56177 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DLX1P56177 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLX1P56177 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLX1P56177 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DLX1P56177 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DLX1P56177 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DLX1P56177 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLX1P56177 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DLX1P56177 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLX1P56177 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DLX1P56177 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLX1P56177 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DLX1P56177 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DLX1P56177 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLX1P56177 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLX1P56177 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DLX1P56177 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLX1P56177 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DLX1P56177 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLX1P56177 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLX1P56177 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLX1P56177 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLX1P56177 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DLX1P56177 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DLX1P56177 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLX1P56177 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DLX1P56177 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLX1P56177 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DLX1P56177 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DLX1P56177 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DLX1P56177 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DLX1P56177 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLX1P56177 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DLX1P56177 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DLX1P56177 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DLX1P56177 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLX1P56177 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLX1P56177 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLX1P56177 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DLX1P56177 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLX1P56177 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DLX1P56177 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLX1P56177 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLX1P56177 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLX1P56177 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLX1P56177 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DLX1P56177 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DLX1P56177 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DLX1P56177 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DLX1P56177 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DLX1P56177 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLX1P56177 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLX1P56177 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLX1P56177 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLX1P56177 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLX1P56177 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLX1P56177 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLX1P56177 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLX1P56177 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLX1P56177 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLX1P56177 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DLX1P56177 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLX1P56177 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLX1P56177 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLX1P56177 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms