Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2A1P52655 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2A1P52655 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2A1P52655 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2A1P52655 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2A1P52655 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2A1P52655 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2A1P52655 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2A1P52655 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms