Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPOLAP51003 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PAPOLAP51003 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPOLAP51003 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPOLAP51003 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAPOLAP51003 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAPOLAP51003 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PAPOLAP51003 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAPOLAP51003 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PAPOLAP51003 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PAPOLAP51003 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAPOLAP51003 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PAPOLAP51003 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAPOLAP51003 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAPOLAP51003 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAPOLAP51003 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPOLAP51003 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAPOLAP51003 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAPOLAP51003 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAPOLAP51003 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAPOLAP51003 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms