Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSC2P49815 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSC2P49815 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSC2P49815 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSC2P49815 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSC2P49815 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSC2P49815 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSC2P49815 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TSC2P49815 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSC2P49815 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSC2P49815 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TSC2P49815 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TSC2P49815 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TSC2P49815 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TSC2P49815 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSC2P49815 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSC2P49815 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TSC2P49815 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSC2P49815 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TSC2P49815 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TSC2P49815 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSC2P49815 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TSC2P49815 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSC2P49815 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TSC2P49815 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSC2P49815 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSC2P49815 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSC2P49815 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TSC2P49815 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TSC2P49815 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TSC2P49815 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TSC2P49815 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC2P49815 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC2P49815 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC2P49815 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC2P49815 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TSC2P49815 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSC2P49815 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TSC2P49815 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TSC2P49815 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSC2P49815 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TSC2P49815 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSC2P49815 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSC2P49815 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSC2P49815 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSC2P49815 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TSC2P49815 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSC2P49815 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSC2P49815 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSC2P49815 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSC2P49815 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSC2P49815 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSC2P49815 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSC2P49815 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TSC2P49815 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSC2P49815 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSC2P49815 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSC2P49815 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TSC2P49815 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSC2P49815 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSC2P49815 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSC2P49815 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TSC2P49815 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSC2P49815 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSC2P49815 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSC2P49815 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSC2P49815 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSC2P49815 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSC2P49815 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSC2P49815 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSC2P49815 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSC2P49815 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSC2P49815 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSC2P49815 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSC2P49815 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSC2P49815 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSC2P49815 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSC2P49815 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSC2P49815 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSC2P49815 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSC2P49815 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TSC2P49815 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSC2P49815 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSC2P49815 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TSC2P49815 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSC2P49815 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSC2P49815 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TSC2P49815 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSC2P49815 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TSC2P49815 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSC2P49815 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TSC2P49815 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TSC2P49815 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSC2P49815 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSC2P49815 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSC2P49815 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSC2P49815 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSC2P49815 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSC2P49815 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSC2P49815 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms