Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TDO2P48775 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TDO2P48775 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TDO2P48775 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TDO2P48775 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TDO2P48775 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TDO2P48775 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TDO2P48775 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TDO2P48775 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TDO2P48775 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TDO2P48775 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TDO2P48775 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TDO2P48775 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TDO2P48775 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TDO2P48775 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TDO2P48775 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TDO2P48775 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TDO2P48775 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TDO2P48775 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TDO2P48775 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TDO2P48775 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TDO2P48775 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TDO2P48775 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TDO2P48775 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TDO2P48775 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TDO2P48775 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TDO2P48775 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TDO2P48775 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TDO2P48775 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TDO2P48775 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TDO2P48775 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TDO2P48775 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TDO2P48775 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TDO2P48775 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TDO2P48775 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TDO2P48775 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TDO2P48775 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TDO2P48775 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TDO2P48775 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TDO2P48775 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TDO2P48775 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TDO2P48775 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TDO2P48775 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TDO2P48775 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TDO2P48775 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
TDO2P48775 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TDO2P48775 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TDO2P48775 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TDO2P48775 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TDO2P48775 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TDO2P48775 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TDO2P48775 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TDO2P48775 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TDO2P48775 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TDO2P48775 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TDO2P48775 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TDO2P48775 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TDO2P48775 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TDO2P48775 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TDO2P48775 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TDO2P48775 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TDO2P48775 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TDO2P48775 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TDO2P48775 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TDO2P48775 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TDO2P48775 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TDO2P48775 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TDO2P48775 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TDO2P48775 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TDO2P48775 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TDO2P48775 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TDO2P48775 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TDO2P48775 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TDO2P48775 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TDO2P48775 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TDO2P48775 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TDO2P48775 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TDO2P48775 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TDO2P48775 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TDO2P48775 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TDO2P48775 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TDO2P48775 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TDO2P48775 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TDO2P48775 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TDO2P48775 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TDO2P48775 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TDO2P48775 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TDO2P48775 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TDO2P48775 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TDO2P48775 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TDO2P48775 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TDO2P48775 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TDO2P48775 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TDO2P48775 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TDO2P48775 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TDO2P48775 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TDO2P48775 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TDO2P48775 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TDO2P48775 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TDO2P48775 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms