Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
UTRNP46939 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
UTRNP46939 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
UTRNP46939 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
UTRNP46939 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
UTRNP46939 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
UTRNP46939 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
UTRNP46939 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
UTRNP46939 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
UTRNP46939 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
UTRNP46939 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
UTRNP46939 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
UTRNP46939 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
UTRNP46939 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
UTRNP46939 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
UTRNP46939 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
UTRNP46939 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
UTRNP46939 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
UTRNP46939 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
UTRNP46939 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
UTRNP46939 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
UTRNP46939 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
UTRNP46939 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
UTRNP46939 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
UTRNP46939 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
UTRNP46939 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
UTRNP46939 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
UTRNP46939 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
UTRNP46939 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
UTRNP46939 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
UTRNP46939 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
UTRNP46939 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
UTRNP46939 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
UTRNP46939 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
UTRNP46939 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
UTRNP46939 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
UTRNP46939 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
UTRNP46939 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
UTRNP46939 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
UTRNP46939 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
UTRNP46939 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
UTRNP46939 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
UTRNP46939 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
UTRNP46939 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
UTRNP46939 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
UTRNP46939 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
UTRNP46939 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
UTRNP46939 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
UTRNP46939 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
UTRNP46939 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
UTRNP46939 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
UTRNP46939 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
UTRNP46939 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
UTRNP46939 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
UTRNP46939 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
UTRNP46939 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
UTRNP46939 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
UTRNP46939 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
UTRNP46939 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
UTRNP46939 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
UTRNP46939 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
UTRNP46939 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
UTRNP46939 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
UTRNP46939 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
UTRNP46939 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
UTRNP46939 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
UTRNP46939 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
UTRNP46939 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
UTRNP46939 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
UTRNP46939 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
UTRNP46939 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
UTRNP46939 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UTRNP46939 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
UTRNP46939 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
UTRNP46939 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
UTRNP46939 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
UTRNP46939 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UTRNP46939 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UTRNP46939 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
UTRNP46939 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UTRNP46939 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
UTRNP46939 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UTRNP46939 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UTRNP46939 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
UTRNP46939 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
UTRNP46939 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
UTRNP46939 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
UTRNP46939 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
UTRNP46939 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
UTRNP46939 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
UTRNP46939 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
UTRNP46939 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
UTRNP46939 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
UTRNP46939 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
UTRNP46939 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
UTRNP46939 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
UTRNP46939 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
UTRNP46939 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
UTRNP46939 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
UTRNP46939 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms