Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCD1P33897 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCD1P33897 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCD1P33897 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCD1P33897 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCD1P33897 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCD1P33897 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCD1P33897 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCD1P33897 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCD1P33897 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCD1P33897 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCD1P33897 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ABCD1P33897 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCD1P33897 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCD1P33897 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCD1P33897 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCD1P33897 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCD1P33897 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCD1P33897 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms