Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDC25CP30307 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC25CP30307 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC25CP30307 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC25CP30307 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC25CP30307 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC25CP30307 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC25CP30307 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDC25CP30307 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDC25CP30307 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms