Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RBMS1P29558 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBMS1P29558 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBMS1P29558 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBMS1P29558 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBMS1P29558 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBMS1P29558 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBMS1P29558 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBMS1P29558 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBMS1P29558 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBMS1P29558 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBMS1P29558 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBMS1P29558 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBMS1P29558 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBMS1P29558 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBMS1P29558 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms