Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
KDM5AP29375 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
KDM5AP29375 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
KDM5AP29375 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.99■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
KDM5AP29375 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
KDM5AP29375 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5AP29375 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
KDM5AP29375 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
KDM5AP29375 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
KDM5AP29375 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
KDM5AP29375 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5AP29375 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
KDM5AP29375 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KDM5AP29375 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
KDM5AP29375 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5AP29375 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
KDM5AP29375 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
KDM5AP29375 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5AP29375 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5AP29375 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
KDM5AP29375 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5AP29375 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5AP29375 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
KDM5AP29375 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
KDM5AP29375 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
KDM5AP29375 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5AP29375 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5AP29375 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5AP29375 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5AP29375 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5AP29375 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
KDM5AP29375 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5AP29375 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5AP29375 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5AP29375 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
KDM5AP29375 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5AP29375 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5AP29375 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.32■■■■□ 3.89
KDM5AP29375 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
KDM5AP29375 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5AP29375 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5AP29375 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5AP29375 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5AP29375 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5AP29375 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms