Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHB2P29323 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB2P29323 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHB2P29323 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHB2P29323 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHB2P29323 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHB2P29323 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHB2P29323 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB2P29323 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHB2P29323 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPHB2P29323 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EPHB2P29323 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EPHB2P29323 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPHB2P29323 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EPHB2P29323 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPHB2P29323 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPHB2P29323 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EPHB2P29323 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB2P29323 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms