Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PVALBP20472 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PVALBP20472 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PVALBP20472 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PVALBP20472 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PVALBP20472 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PVALBP20472 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PVALBP20472 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PVALBP20472 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PVALBP20472 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PVALBP20472 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PVALBP20472 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PVALBP20472 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PVALBP20472 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PVALBP20472 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PVALBP20472 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PVALBP20472 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PVALBP20472 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PVALBP20472 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PVALBP20472 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PVALBP20472 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PVALBP20472 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PVALBP20472 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PVALBP20472 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PVALBP20472 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PVALBP20472 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PVALBP20472 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PVALBP20472 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PVALBP20472 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PVALBP20472 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PVALBP20472 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PVALBP20472 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PVALBP20472 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PVALBP20472 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PVALBP20472 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PVALBP20472 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PVALBP20472 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PVALBP20472 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PVALBP20472 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PVALBP20472 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PVALBP20472 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PVALBP20472 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PVALBP20472 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PVALBP20472 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PVALBP20472 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PVALBP20472 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PVALBP20472 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PVALBP20472 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PVALBP20472 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PVALBP20472 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PVALBP20472 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PVALBP20472 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PVALBP20472 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PVALBP20472 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PVALBP20472 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PVALBP20472 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PVALBP20472 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PVALBP20472 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PVALBP20472 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PVALBP20472 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PVALBP20472 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PVALBP20472 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PVALBP20472 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PVALBP20472 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PVALBP20472 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PVALBP20472 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PVALBP20472 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PVALBP20472 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PVALBP20472 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PVALBP20472 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PVALBP20472 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PVALBP20472 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PVALBP20472 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PVALBP20472 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PVALBP20472 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PVALBP20472 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PVALBP20472 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PVALBP20472 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PVALBP20472 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PVALBP20472 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PVALBP20472 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PVALBP20472 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PVALBP20472 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PVALBP20472 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PVALBP20472 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PVALBP20472 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PVALBP20472 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PVALBP20472 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PVALBP20472 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PVALBP20472 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PVALBP20472 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PVALBP20472 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PVALBP20472 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PVALBP20472 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PVALBP20472 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PVALBP20472 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PVALBP20472 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PVALBP20472 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PVALBP20472 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PVALBP20472 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms