Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA2P20248 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA2P20248 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA2P20248 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA2P20248 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNA2P20248 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA2P20248 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA2P20248 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA2P20248 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNA2P20248 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNA2P20248 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNA2P20248 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNA2P20248 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNA2P20248 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNA2P20248 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms