Protein–RNA interactions for Protein: P09914

IFIT1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT1P09914 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFIT1P09914 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFIT1P09914 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFIT1P09914 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFIT1P09914 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
IFIT1P09914 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
IFIT1P09914 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
IFIT1P09914 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
IFIT1P09914 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFIT1P09914 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFIT1P09914 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
IFIT1P09914 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFIT1P09914 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFIT1P09914 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IFIT1P09914 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
IFIT1P09914 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
IFIT1P09914 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
IFIT1P09914 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
IFIT1P09914 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFIT1P09914 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IFIT1P09914 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
IFIT1P09914 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
IFIT1P09914 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IFIT1P09914 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
IFIT1P09914 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
IFIT1P09914 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IFIT1P09914 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFIT1P09914 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IFIT1P09914 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFIT1P09914 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFIT1P09914 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFIT1P09914 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFIT1P09914 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms