Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBP08949 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NMBP08949 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NMBP08949 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMBP08949 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBP08949 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NMBP08949 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBP08949 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBP08949 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBP08949 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NMBP08949 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBP08949 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBP08949 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBP08949 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBP08949 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NMBP08949 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBP08949 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBP08949 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NMBP08949 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBP08949 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBP08949 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NMBP08949 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMBP08949 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMBP08949 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBP08949 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBP08949 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBP08949 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMBP08949 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBP08949 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBP08949 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMBP08949 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBP08949 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMBP08949 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBP08949 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBP08949 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMBP08949 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBP08949 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBP08949 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMBP08949 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NMBP08949 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBP08949 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMBP08949 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBP08949 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBP08949 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMBP08949 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBP08949 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMBP08949 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBP08949 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMBP08949 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBP08949 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBP08949 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMBP08949 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMBP08949 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMBP08949 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBP08949 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMBP08949 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMBP08949 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMBP08949 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMBP08949 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMBP08949 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMBP08949 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMBP08949 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NMBP08949 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMBP08949 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMBP08949 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMBP08949 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMBP08949 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMBP08949 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMBP08949 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMBP08949 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMBP08949 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMBP08949 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBP08949 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBP08949 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBP08949 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NMBP08949 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NMBP08949 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBP08949 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBP08949 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NMBP08949 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBP08949 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBP08949 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBP08949 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBP08949 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NMBP08949 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NMBP08949 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NMBP08949 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBP08949 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBP08949 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBP08949 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBP08949 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBP08949 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBP08949 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBP08949 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBP08949 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBP08949 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBP08949 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMBP08949 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMBP08949 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBP08949 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms