Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFHP08603 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFHP08603 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFHP08603 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFHP08603 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFHP08603 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFHP08603 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFHP08603 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CFHP08603 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFHP08603 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFHP08603 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CFHP08603 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CFHP08603 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFHP08603 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFHP08603 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFHP08603 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFHP08603 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFHP08603 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFHP08603 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFHP08603 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CFHP08603 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFHP08603 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFHP08603 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFHP08603 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFHP08603 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFHP08603 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFHP08603 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFHP08603 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFHP08603 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFHP08603 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFHP08603 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFHP08603 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFHP08603 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFHP08603 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFHP08603 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFHP08603 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFHP08603 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFHP08603 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFHP08603 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFHP08603 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFHP08603 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFHP08603 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFHP08603 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CFHP08603 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CFHP08603 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFHP08603 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFHP08603 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFHP08603 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFHP08603 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFHP08603 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFHP08603 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFHP08603 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFHP08603 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFHP08603 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFHP08603 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFHP08603 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFHP08603 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFHP08603 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFHP08603 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFHP08603 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFHP08603 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFHP08603 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CFHP08603 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFHP08603 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CFHP08603 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFHP08603 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CFHP08603 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFHP08603 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFHP08603 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFHP08603 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CFHP08603 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFHP08603 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFHP08603 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFHP08603 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFHP08603 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFHP08603 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFHP08603 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFHP08603 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFHP08603 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFHP08603 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFHP08603 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFHP08603 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFHP08603 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFHP08603 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFHP08603 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFHP08603 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFHP08603 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFHP08603 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFHP08603 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFHP08603 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFHP08603 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFHP08603 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CFHP08603 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFHP08603 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFHP08603 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFHP08603 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFHP08603 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFHP08603 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFHP08603 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFHP08603 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms